Le fonds documentaire de l'Institut est constitué d’ouvrages, de revues, de périodiques et de rapports spécialisés consacrés à l’ensemble des thèmes et sujets économiques en Tunisie et dans le monde, il s'agit d'une documentation riche et variée, environ 7300 ouvrages tunisiens et autres, 1860 documents publiés par la banque mondiale répertoriés et informatisés. Les périodiques représentent l’essentiel du fonds documentaire et couvrent les domaines relatifs aux axes de recherche de l’Institut. L’IEQ reçoit environ 200 titres de revues, et gère une collection d'environ 700 titres de périodiques. Le fonds documentaire est également constitué par les rapports d’études, les notes et documents de travail élaborés à l’Institut depuis sa création jusqu’à l’année en cours.  En 2004  l'Institut a reçu  environ  835 numéros de périodiques et 150 titres des publications de la Banque Mondiale.

Le Centre de documentation gère également un ensemble de banques de données économiques et statistiques qui représentent une source d’informations fondamentale pour l’actualisation des travaux de recherche.

C’est depuis 1994 que l’Institut a ajouté à l’ensemble de ses missions, celle d’assurer la fonction de dépositaire des publications de la Banque Mondiale. A ce titre, la bibliothèque de l’Institut reçoit régulièrement les rapports annuels, les publications statistiques, les notes techniques, les études économiques et régionales ainsi que les bulletins de la Banque. Le fonds documentaire de la Banque Mondiale couvre l’essentiel de ses publications et compte environ 1700 titres.